Comprendre le séquençage NGS (Next Generation Sequencing)
Public admis
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- Entreprise
- Etudiant
Financements
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Objectifs de la formation
- Comprendre les principes fondamentaux du séquençage digital d’ADN, ou Séquençage Nouvelle Génération (NGS)
- Construire un protocole expérimental dédié à l’analyse d’un gène, d’un groupe de gènes, d’un génome, ou d’un transcriptome
- Comprendre les différentes technologies disponibles aujourd’hui (454, Illumina et IonTorrent)
- Comprendre les bases des protocoles (matériel de départ, construction des librairies, séquençage, validation des résultats)
| Tarif |
A partir de 1 160,00 € |
| Durée | 14 heures sur 2 jours |
| Modes |
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| Sessions | |
| Lieux | Partout en France |
| Tarif |
A partir de 1 160,00 € |
| Durée | 14 heures sur 2 jours |
| Modes |
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| Sessions | |
| Lieux | Partout en France |
Programme
Jour 1 - Matin
1. Décrire les principes fondamentaux du séquençage NGS
- Introduction au séquençage NGS : historique et évolution.
- Principe de base du séquençage NGS : technologie, avantages et limites.
- Types de séquençage NGS : séquençage de l'ADN, de l'ARN, du génome complet, du exome, etc.
2. Expliquer le processus de préparation des échantillons pour le séquençage NGS
- Préparation des échantillons : extraction de l'ADN/ARN, quantification et contrôle qualité.
- Préparation de la librairie : fragmentation, ajout d'adaptateurs et amplification.
- Contrôle qualité de la librairie et quantification.
Jour 1 - Après-midi
3. Présenter les différentes technologies de deuxième et troisième génération (Illumina, Ion Torrent, MGI, AVITI, PacBio, Oxford Nanopore
- Capacité
- Flow cell
- Gestion des librairies
- Utilisations et applications
Jour 2 - Matin
4. Analyser et sélectionner les données issues du séquençage NGS
- Introduction à l'analyse des données NGS : alignement, identification des variants, annotation.
- Identification de SNPs, gènes individuels, ou groupe de gènes.
- Logiciels et outils pour l'analyse des données NGS
- Interprétation des résultats : identification des variants pathogènes, analyse comparative, etc.
- Application en recherche fondamentale: régulation des gènes et épigénétique
5. Évaluer les différentes méthodes de séquençage NGS et choisir la plus adaptée à une situation donnée
- Reséquençage de gènes et de génomes (bactériens ou eucaryotes).
- Analyse d’ARN, miRNA ou transcriptome.
- Séquençage de novo.
- Comparaison des différentes méthodes de séquençage NGS : avantages, limites et applications.
- Choix de la méthode de séquençage NGS : critères de choix, coût, délai, précision, etc.
Jour 2 - Après-midi
6. Présenter les résultats du séquençage
- Présentation du logiciel
- Principes du contrôle qualité des données
- Concertation biologique et intégration des données cliniques
Prérequis
Public
- Niveau Initiation
- Socle de compétences en fin de formation
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Objectifs de la formation
À l'issue de la formation, les participants seront en mesure de mieux comprendre et gérer leur stress professionnel. Ils auront acquis des compétences pour optimiser leur gestion du temps et des priorités, ce qui leur permettra d'améliorer leur performance au travail et de favoriser un meilleur équilibre entre vie professionnelle et personnelle.
| Tarif |
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| Durée |
2j / 14h |
| Modes |
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Public concerné
Toute personne appelée à, ou souhaitant, devenir Correspondant Informatique et Libertés (CIL) ou Délégué à la Protection des Données (DPD/DPO)
Pré-requis
Aucun
| Tarif |
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| Durée |
3 jour(s) |
| Modes |
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Objectifs de la formation
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| Tarif |
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| Durée |
2j / 14h |
| Modes |
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| Durée |
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