Comprendre le séquençage NGS (Next Generation Sequencing)
Public admis
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Objectifs de la formation
- Comprendre les principes fondamentaux du séquençage digital d’ADN, ou Séquençage Nouvelle Génération (NGS)
- Construire un protocole expérimental dédié à l’analyse d’un gène, d’un groupe de gènes, d’un génome, ou d’un transcriptome
- Comprendre les différentes technologies disponibles aujourd’hui (454, Illumina et IonTorrent)
- Comprendre les bases des protocoles (matériel de départ, construction des librairies, séquençage, validation des résultats)
| Tarif |
A partir de 1 160,00 € |
| Durée | 14 heures sur 2 jours |
| Modes |
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| Sessions | |
| Lieux | Partout en France |
| Tarif |
A partir de 1 160,00 € |
| Durée | 14 heures sur 2 jours |
| Modes |
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| Sessions | |
| Lieux | Partout en France |
Programme
Jour 1 - Matin
1. Décrire les principes fondamentaux du séquençage NGS
- Introduction au séquençage NGS : historique et évolution.
- Principe de base du séquençage NGS : technologie, avantages et limites.
- Types de séquençage NGS : séquençage de l'ADN, de l'ARN, du génome complet, du exome, etc.
2. Expliquer le processus de préparation des échantillons pour le séquençage NGS
- Préparation des échantillons : extraction de l'ADN/ARN, quantification et contrôle qualité.
- Préparation de la librairie : fragmentation, ajout d'adaptateurs et amplification.
- Contrôle qualité de la librairie et quantification.
Jour 1 - Après-midi
3. Présenter les différentes technologies de deuxième et troisième génération (Illumina, Ion Torrent, MGI, AVITI, PacBio, Oxford Nanopore
- Capacité
- Flow cell
- Gestion des librairies
- Utilisations et applications
Jour 2 - Matin
4. Analyser et sélectionner les données issues du séquençage NGS
- Introduction à l'analyse des données NGS : alignement, identification des variants, annotation.
- Identification de SNPs, gènes individuels, ou groupe de gènes.
- Logiciels et outils pour l'analyse des données NGS
- Interprétation des résultats : identification des variants pathogènes, analyse comparative, etc.
- Application en recherche fondamentale: régulation des gènes et épigénétique
5. Évaluer les différentes méthodes de séquençage NGS et choisir la plus adaptée à une situation donnée
- Reséquençage de gènes et de génomes (bactériens ou eucaryotes).
- Analyse d’ARN, miRNA ou transcriptome.
- Séquençage de novo.
- Comparaison des différentes méthodes de séquençage NGS : avantages, limites et applications.
- Choix de la méthode de séquençage NGS : critères de choix, coût, délai, précision, etc.
Jour 2 - Après-midi
6. Présenter les résultats du séquençage
- Présentation du logiciel
- Principes du contrôle qualité des données
- Concertation biologique et intégration des données cliniques
Prérequis
Public
- Niveau Initiation
- Socle de compétences en fin de formation
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The course begins by describing IBM MQ and the effect of design and development choices in the IBM MQ environment. It then covers IBM MQ application programming topics such as methods of putting and getting messages, identifying code that creates queue manager affinities, working with transactions, and uses of the publish/subscribe messaging style.
Finally, the course describes the IBM MQ Light interface, introduces Advanced Message Queuing Protocol (AMQP), and explains how to set up an AMQP channel and how to interface with IBM MQ Light.
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Objectifs de la formation
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A partir de 1 850,00 € |
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Objectifs de la formation
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A partir de 1 370,00 € |
| Durée |
2j / 14h |
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Objectifs de la formation
A l'issue de cette formation, vous serez capable de :
- Analyser votre relation au temps et ses messages contraignants pour mieux comprendre vos axes de progrès
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| Tarif |
A partir de 1 470,00 € |
| Durée |
2j / 14h |
| Modes |
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Objectifs de la formation
- Développer une offre de service.
- Établir une structure adaptée, développer son réseau.
- Prospecter, comprendre les besoins du marché et des clients.
- Définir l'offre d'intervention et la politique tarifaire.
| Tarif |
A partir de 1 530,00 € |
| Durée |
2 jours (14 heures) |
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Objectifs de la formation
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| Tarif |
A partir de 2 430,00 € |
| Durée |
4 jour(s) |
| Modes |
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