Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique
Public admis
- Salarié en Poste
- Demandeur d'emploi
- Entreprise
- Etudiant
Financements
Eligible CPF Votre OPCO Financement personnel
Objectifs de la formation
- Comprendre les principes fondamentaux du séquençage haut débit
- Maîtriser les techniques et les étapes clés du séquençage haut débit
- Analyser et interpréter les données générées par le séquençage haut débit
| Tarif |
A partir de 1 740,00 € |
| Durée | 21 heures sur 3 jours |
| Modes |
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| Sessions | |
| Lieux | Partout en France |
| Tarif |
A partir de 1 740,00 € |
| Durée | 21 heures sur 3 jours |
| Modes |
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| Sessions | |
| Lieux | Partout en France |
Programme
Jour 1 - Matin
1. Expliquer les principes et les technologies du séquençage haut débit
- Évolution du séquençage de l'ADN et introduction au séquençage haut débit
- Comparaison des principales technologies de séquençage haut débit : Illumina, Ion Torrent, PacBio, Oxford Nanopore, etc.
- Principe de base de la génération de données de séquençage haut débit
2. Décrire les étapes pré-séquençage
- Extraction et purification de l'ADN ou de l'ARN à partir d'échantillons biologiques
- Préparation des bibliothèques d'ADN ou d'ARN pour le séquençage
- Contrôles de qualité et quantification des échantillons avant le séquençage
Jour 1 - Après-midi
3. Décrire les étapes de séquençage
- Introduction aux techniques d'amplification et de clonage pour l'amplification des échantillons avant le séquençage
- Utilisation des plates-formes de séquençage haut débit pour la génération de données
- Principe de la lecture des séquences et de la génération des signaux
Jour 2 - Matin
4. Analyser les données de séquençage haut débit
- Contrôle qualité des données brutes et filtrage des séquences de mauvaise qualité
- Alignement des lectures sur un génome de référence ou assemblage de novo des séquences
- Analyse des variants génétiques, détection des mutations, et annotation des résultats
Jour 2 - Après-midi
5. Interpréter les résultats et analyser les données
- Étude de l'expression génique différentielle et de la régulation des gènes par le séquençage RNA-Seq
- Analyse des variations génétiques, des mutations somatiques et de la variation de l'ADN
- Exploration des données épigénétiques et des modifications de la chromatine par le séquençage ChIP-Seq ou Bisulfite-Seq
Prérequis
Public
- Niveau Initiation
- Socle de compétences en fin de formation
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