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Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique

Qualiopi
À partir de 1740 €
Durée 21h en 3 jours
Localisation Partout en France
Logo de BIOFORMATION - Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique

Proposé par

BIOFORMATION

Prérequis

Connaissances de base en biologie moléculaire et en PCR

Public admis

  • Salarié en Poste
  • Entreprise

Demandeur d'emploi et Etudiant non admis

Financement

  • Votre OPCO
  • Financement personnel

Financement CPF non pris en charge

Modalités

  • En centre
  • En entreprise
  • À distance

Objectifs pédagogiques

  • Comprendre les principes fondamentaux du séquençage haut débit
  • Maîtriser les techniques et les étapes clés du séquençage haut débit
  • Analyser et interpréter les données générées par le séquençage haut débit

Programme de la formation

Jour 1 - Matin

1. Expliquer les principes et les technologies du séquençage haut débit
  • Évolution du séquençage de l'ADN et introduction au séquençage haut débit
  • Comparaison des principales technologies de séquençage haut débit : Illumina, Ion Torrent, PacBio, Oxford Nanopore, etc.
  • Principe de base de la génération de données de séquençage haut débit
2. Décrire les étapes pré-séquençage
  • Extraction et purification de l'ADN ou de l'ARN à partir d'échantillons biologiques
  • Préparation des bibliothèques d'ADN ou d'ARN pour le séquençage
  • Contrôles de qualité et quantification des échantillons avant le séquençage

Jour 1 - Après-midi

3. Décrire les étapes de séquençage
  • Introduction aux techniques d'amplification et de clonage pour l'amplification des échantillons avant le séquençage
  • Utilisation des plates-formes de séquençage haut débit pour la génération de données
  • Principe de la lecture des séquences et de la génération des signaux

Jour 2 - Matin

4. Analyser les données de séquençage haut débit
  • Contrôle qualité des données brutes et filtrage des séquences de mauvaise qualité
  • Alignement des lectures sur un génome de référence ou assemblage de novo des séquences
  • Analyse des variants génétiques, détection des mutations, et annotation des résultats

Jour 2 - Après-midi

5. Interpréter les résultats et analyser les données
  • Étude de l'expression génique différentielle et de la régulation des gènes par le séquençage RNA-Seq
  • Analyse des variations génétiques, des mutations somatiques et de la variation de l'ADN
  • Exploration des données épigénétiques et des modifications de la chromatine par le séquençage ChIP-Seq ou Bisulfite-Seq
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Proposé par

BIOFORMATION

"Le meilleur de la formation en Biologie Médicale"

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